山东省农业环境污染控制工程技术研究中心于2006年12月由山东省科技厅批准建设。主要开展农药污染控制、肥料污染控制、畜禽养殖污染控制和水土保持与生态安全等工作。
    农药污染控制方面主要开展农药残留方法的建立和农药残留标准的制订；农药污染控制与修复研究及示范；环境中残留农药对生物的生态环境毒性研究。
    肥料污染控制方面主要通过控释肥的研制来控制对环境的污染。畜禽养殖污染控制主要通过养殖的全过程来控制对环境的污染。水土保持与生态安全主要通过工程等措施减缓水土流失和生态安全。
    中心主任为资源与环境学院的朱鲁生教授。